火影忍者手游特全商店（即特权商店）的打开方式是：先将账号VIP等级提升至V7及以上，再点击游戏主界面右上角的商城图标，进入商城后即可找到并打开特权商店。
特权商店的开启核心门槛是VIP等级，账号达到V7后，该商店入口会永久解锁，无需额外完成任务或满足其他条件。主界面右上角的商城图标是进入所有商店的总入口，点击后会进入商城主页面，页面内会清晰划分道具商店、特权商店、礼包商店等板块，直接点击特权商店标签就能进入专属界面。未达到V7的账号，在商城页面中特权商店入口会显示为锁定状态，无法点击进入，只有提升VIP等级才能解锁。
进入特权商店后，玩家可购买各类稀有忍者碎片、高级勾玉等核心道具，商品会定时刷新，玩家也可手动指定前两个商品位的忍者碎片，指定第一个位置消耗1张高招券，第二个位置消耗3张高招券，方便精准获取目标忍者碎片。开通超影服务可永久享受特权商店85折优惠，大幅降低购买成本，日常还可关注幸运折扣活动，活动期间全服玩家可享7折及以上优惠，性价比更高。
除了永久开启的特权商店，游戏还会不定期推出限时开放活动，活动期间所有玩家均可临时进入特权商店购买道具，无需满足VIP等级要求。这类限时活动通常持续数天，是低VIP玩家获取稀有碎片的重要途径，活动入口同样在商城页面，开启后特权商店入口会自动解锁，活动结束后入口恢复锁定状态。
特权商店的商品刷新机制固定，每日会在固定时段自动更新，玩家也可消耗金币手动刷新，快速刷出所需道具。商店内的积分兑换功能也很实用，每2080积分可兑换3片S忍碎片，积分通过购买商店内商品积累，购买时合理规划数量，可让积分刚好满足兑换需求，最大化利用资源。
